Завершение фильма оставляет возможность различных интерпретаций: очевидно, что Синдзи в какой-то момент преодолел проблемы сосуществования с окружающими и пришёл к готовности жить с ними, но был ли завершён «Проект содействия человечеству» и происходила ли вообще искусственная эволюция, остаётся нераскрытым напрямую.
Детали и сущность «содействия» в сериале также не раскрываются.
В «End of Evangelion» Синдзи запускает «содействие», но позже отменяет его. Размышления в конце сериала, как считают некоторые, происходят одновременно с действием «End of Evangelion», другие зрители считают, что сюжеты двух произведений не связаны, либо показывают две различные возможные развязки.