Действие происходит в 2015 году. За 15 лет до этого произошла ужасная катастрофа - всеобщее потепление или Второй Удар. Растаяли льды Антарктиды, погибло три четверти человечества, большая часть суши оказалась под водой. Секретная организация «NERV» создает Токио-3 - огромную военную базу. Задача Токио-3 - защита человечества от таинственных гигантских Ангелов или Посланников. Единственное оружие, могущее им противостоять - пилотируемые биороботы серии «Евангелион». Однако управлять «Евами» могут только подростки, зачатые после Второго Удара...